现在较常用的质粒提取方法有三种:
碱裂解法、煮沸法、去污剂裂解法【碱裂解法、煮沸法较为剧烈，适用于较小的质粒（＜15Kb），去污剂裂解法比较温合，用于分子量较大的质粒（＞15Kb）】
碱裂解法是一种广泛使用的制备质粒DNA的方法。其原理为：染色体DNA远远大于质粒DNA，染色体DNA为线状分子，而质粒为共价闭合环状分子。当pH 12.0-12.6碱性环境中，线性的大分子的染色体DNAwan全变性，而共价闭环质粒DNA在将PH调至中性后即可以恢复其天然构象，在高盐浓度存在的条件下，染色体DNA和蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀，而质粒DNA仍为可溶状态，通过离心可除去大部分细胞碎片、染色体DNA、RNA及蛋白质，质粒DNA仍在上清中。
质粒是真核细胞细胞核外或原核生物拟核区外能够进行复制的遗传单位，包括真核生物的细胞器（主要指线粒体和叶绿体）中和细菌细胞拟核区以外的环状脱氧核糖核酸分子。现在习惯上用来指细菌(大肠杆菌）、酵母菌和放线菌等生物中细胞核或拟核中的DNA以外的DNA分子。在基因工程中质粒常被用做基因的载体。质粒上常有抗生素的抗性基因，例如，四环素抗性基因或卡那霉素抗性基因等。有些质粒称为附加体，这类质粒能够整合进细菌的染色体，也能从整合位置上切离下来成为游离于染色体外的DNA分子。质粒在宿主细胞体内外都可复制。
目，已发现有质粒的细菌有几百种，已知的大多数的细菌质粒都是共价闭合环状DNA分子(简称cccDNA)。细菌质粒的相对分子质量一般较小，约为细菌染色体的0.5%～3%。根据相对分子质量的大小，大致上可以把质粒分成大小两类：较大一类的相对分子质量是40×106以上，较小一类的相对分子质量是10×106以下(少数质粒的相对分子质量介于两者之间)。每个细胞中的质粒数主要决定于质粒本身的复制特性。
按照复制性质，可以把质粒分为两类：一类是严紧型质粒，当细胞染色体复制一次时，质粒也复制一次，每个细胞内只有1～2个质粒；另一类是松弛型质粒，当染色体复制停止后仍然能继续复制，每一个细胞内一般有20个左右质粒。这些质粒的复制是在寄主细胞的松弛控制之下的，每个细胞中含有10-200份拷贝，如果用一定的药物处理抑制寄主蛋白质的合成还会使质粒拷贝数增至几千份。
一、质粒提取原理
现在较常用的质粒提取方法有三种:碱裂解法、煮沸法和去污剂裂解法，两种方法较为剧烈，适用于较小的质粒（＜15Kb），而去污剂裂解法则比较温合，一般用于分子量较大的质粒（＞15Kb）。
碱裂解法是一种广泛使用的制备质粒DNA的方法。其原理为：染色体DNA远远大于质粒DNA，染色体DNA为线状分子，而质粒为共价闭合环状分子。当pH 12.0-12.6碱性环境中，线性的大分子的染色体DNAwan全变性，而共价闭环质粒DNA在将PH调至中性后即可以恢复其天然构象，在高盐浓度存在的条件下，染色体DNA和蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀，而质粒DNA仍为可溶状态，通过离心可除去大部分细胞碎片、染色体DNA、RNA及蛋白质，质粒DNA仍在上清中。
二、质粒提取常见问题分析
1、影响质粒提取的因素
质粒提取的得率和质量与很多因素有关，如宿主菌的种类和培养条件、细菌细胞的裂解、质粒拷贝数、质粒的稳定性、抗生素、吸附膜的吸附能力、提取操作的熟练程度等等。
2、为什么从革兰氏阳性菌中提取质粒要在悬浮液中加入溶菌酶？
革兰氏阳性菌有一层细胞壁，必须加入溶菌酶才能使之溶解。
3、如何根据实验需要选择不同别的产品
①从纯度上：各种常规操作,包括酶切、PCR、测序、文库筛选、连接和转化，普通纯度的质粒可以满足要求；而对于转染实验，则要求使用高纯度质粒提取试剂盒方能满足要求。
②从提取的量上：1-20μg，应选择小量提取试剂盒；20-40μg，应选择中量提取试剂盒；大于40μg，应选择大量提取试剂盒。
③从宿主菌上：分为普通细菌质粒提取试剂盒、G+菌质粒提取试剂盒和酵母菌质粒提取试剂盒，根据情况进行选择。
原创作者：上海elisa生物技术有限公司
