一、目的研究基因的表达和调控时,需要从组织或细胞中分离纯化RNA。RNA质量的高低经常影响RT-PCR、cDNA库构建和Northern Blot等分子生物学实验的成败。
二、主要试剂
Trizol是一种新型总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞,抑制细胞释放出的核酸酶。
1. Trizol试剂含有苯酚,具有毒性和刺激性,注重操作。
2. RNase污染的主要来源是操作过程中手和空气中的浮沉,注重配带手套,样品尽可能盖严。
3. 细胞裂解必需充分且操作迅速。细胞裂解之后要看不见颗粒状物质(结缔组织和骨除外)。在清洗和裂解细胞时在低温下操作,防止在操作过程中释放的内源RNase降解了RNA。
4. 酵母和一些细菌由于细胞壁的特别结构,可以加入Trizol试剂同时加入无RNase的玻璃珠并剧烈振荡,使细胞裂解充分。2-8℃ 避光保存一年。
三、准备工作
1.在玻璃烧杯中注入去离子水,加入DEPC使其终浓度为0.05%~0.1%(DEPC-H2O)。(DEPC二乙基焦碳酸酯为活性很强的剧毒物,须在通风橱中小心使用)。
2.将待处理的塑料制品放入一个可以高温灭菌的容器中,注入DEPC-H2O,使塑料制品的所有部分都浸泡到溶液中,在通风柜中37℃ 或室温下处理过夜。
3.将DEPC-H2O小心倒入废液瓶中,将装有DEPC- H2O 处理过的塑料制品的容器以铝箔封口,高温高压蒸汽灭菌至少30分钟。
4.灭菌塑料制品烘烤干燥,置洁净处备用。
四、实验步骤如下
1.取50~100mg的组织加入1 ml Trizol试剂,用匀浆器打匀(Trizol 先放于冰上)。
2.将匀浆室温放置5 min。
3.加入200 μl 剧烈震荡混匀30s,冰上静置3 min。
4.12000 rpm,4℃ 离心15 min。
5.将上清液小心转移到新的1.5 ml离心管中(取400 μl ),加入等量体积的异丙醇,上下颠倒几次混匀,室温下放置15 min。(此步中留意:不要吸取任何中间层物质,宁缺勿滥。)
6.12000 rpm,4℃ 离心15 min 。
7.小心移去上清液,防止RNA沉淀丢失。
8.用70%乙醇(DEPC处理的水配制)洗涤1次,加入700 μl乙醇,将RNA沉淀弹起,漂洗。(此时RNA是不溶解的)
9.8000 rpm,室温离心10min。
10.尽可能地吸走上清,防止RNA沉淀丢失。
11.真空离心干燥3~5分钟,或放在室温下使乙醇挥发掉。
12.沉淀用30 μl DEPC-H2O溶解。如发现沉淀难溶,68 ℃处理10 min。
13.RNA检测
①测定样品在260 nm和280 nm的吸光值 按1OD=40 μg/ ml RNA计算RNA的产量。OD260/OD280在1.8-2.0 。
②进行甲醛变性琼脂糖凝胶电泳确定RNA的完整性和污染情况。
原创作者:上海elisa生物技术有限公司